A base de um programa de monitorização ambiental (PMA) é a amostragem e análise sistemáticas do ambiente de produção para identificar potenciais fontes de contaminação, como patogénos, alérgenos, microrganismos deteriorantes e outros contaminantes. Trata-se essencialmente de um método científico para validar a eficácia de um sistema de segurança alimentar. Em resumo, as atividades de amostragem de superfície e de produto fornecem informações sobre a presença de contaminantes e microrganismos indicadores. Isso ajuda a identificar as causas raízes dos problemas e orienta as estratégias de remediação e prevenção. Responde às perguntas "o que" está presente e "onde" está presente, mas não nos diz "por que" está lá ou "como" chegou lá. 

É aqui que o estudo da transmissão aérea ou por aerossóis pode se mostrar inestimável para aumentar a eficácia de um sistema de segurança alimentar. A transmissão por aerossóis é a transmissão de um microrganismo por meio de pequenas partículas suspensas no ar. Os microrganismos de interesse num ambiente de produção de microrganismos (EMP) são todos capazes de transmissão aérea por meio de atividades humanas normais, como levantar poeira, pulverizar líquidos ou quaisquer atividades que gerem partículas ou gotículas de aerossol — o que engloba tudo o que é feito durante os processos de produção e desinfeção.